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바이러스-숙주 상호작용과 진화

저의 연구는 대규모 비교유전체 분석, 계통분석, 실험 데이터를 통합하여, 바이러스와 숙주가 어떻게 상호작용하며 진화해 왔는지, 그리고 서로의 진화에 어떤 영향을 미쳐 왔는지를 실제 사례를 통해 보여주는 것을 목표로 합니다. 궁극적으로는 감염병의 예측, 감시, 제어에 기여할 수 있는 바이러스 진화에 대한 보다 깊은 이해를 구축하고자 합니다.

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포유류 태반의 진화에 대한 LTR레트로엘리먼트의 역할

포유류 게놈 내 유전자는 일부는 LTR레트로엘리먼트라고 불리는 고대 바이러스 유사 엘리먼트에서 유래한 유전자가 있다. 이들 유전자 중에는 PEG10, RTL1, syncytin 유전자 등이 있으며, 수아강(태반이 있는 포유류)의 태반 발달에 중요한 역할을 하는 것으로 잘 알려져 있다.  포유류 게놈 내 LTR레트로엘리먼트의 대부분은 유전적 구조가 유사하기 때문에, 우리는 생물정보학, 계통학 및 실험적 분석을 통합하여 포유류 계통에서 이들 LTR레트로엘리먼트의 진화적 역할을 종합적으로 검토하였다. 그 결과, LTR레트로엘리먼트에서 유래한 NYNRIN 유전자가 영양막 세포로의 침입을 촉진함으로써 수아강 줄기 계통에서 태반의 출현에 기여했을 가능성을 시사하는 증거를 발견하였다.

​(NYNRIN 논문)

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SARS-CoV-2와 관련 코로나바이러스의 진화

중증급성호흡기증후군 코로나바이러스 2(SARS-CoV-2)는 2019년에 출현하여 코로나19의 대유행을 일으키는 코로나바이러스다. SARS-CoV-2의 급속한 진화는 다른 바이러스학적 및 병리학적 특성을 가진 새로운 변이종의 출현을 가져온다. 인간에 대한 건강 및 경제적 리스크를 평가하기 위해서 저는 The Genotype to Phenotype Japan (G2P-Japan) 컨소시엄과 공동으로 BA.2, XBB.1.5, XBB.1.16, EG.5.1, HK.3 및 JN.1을 포함한 과거의 주요 SARS-CoV-2 변이종과 동남아시아에서 동정한 SARS-CoV-2 관련 BANAL-20-236도RacCS20637의 진화사와 바이러스학적 특징을 조사하고 있다.

SARS-CoV-2 논문 (XBB.1.5, ​XBB.1.16EG.5.1)

SARS-CoV-2 관련 코로나바이러스 논문 (BANAL-20-236, RacCS20637)

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